Na Oddelku za biologijo je mikroskopija pomemben del raziskovalnega dela. Raziskovalci imajo na voljo stereomikroskope, svetlobne mikroskope z različnimi kontrastnimi tehnikami in možnostjo analize slike, ter vrstični in presevni elektronski mikroskop.
Mehanoreceptorji na glavi dvokrilca
Vrstični EM
Bakteriofag
Presevni EM, negativno kontrastiranje suspenzije
Bakterije v črevesju izopodnega raka Porcellio scaber
Apotome, diferencialni interferenčni kontrast (levo), desno fluorescenca oligonukleotidne sonde, optična rezina z Apotomom