Biokemija za študente biotehnologije - izbrana poglavja

Predavatelja

prof. dr. Kristina Sepčić, Katedra za biokemijo, Oddelek za biologijo, BF

prof. dr. Gregor Anderluh, Katedra za biokemijo, Oddelek za biologijo, BF

Literatura

Predavanja sledijo poglavjem v knjigi Concepts in Biochemistry, Rodney Boyer. 2nd Edition, John Wiley and Sons, Inc., New York.

Predstavitve s predavanj

1. NUKLEINSKE KISLINE

Kemijska struktura, zgradba nukleotidov. Nukleinske kisline, DNA, RNA. Struktura DNA. Dvojni heliks- struktura in lastnosti. Struktura RNA. Struktura tRNA. Struktura rRNA. Cepitev DNA, nukleaze. Kompleksi nukleinske kisline-protein. Nukleosom.

2. AMINOKISLINE, PEPTIDI, DELO S PROTEINI

Aminokisline- zgradba, lastnosti. Disociacija, polarnost, reaktivnost, spektroskopske lastnosti. Peptidna vez. Peptidi. Proteini. Lastnosti proteinov. Nivoji proteinske zgradbe. Primarna zgradba. Določevanje primarne zgradbe. Zakaj je pomembno poznavanje primarne zgradbe. Primer hemoglobina. Primer hemaglutinina virusa gripe.

3. ZGRADBA PROTEINOV

Sile, ki stabilizirajo 3D zgradbo proteinov. Peptidna vez. Alfa heliks, beta nagubana ravnina, beta obrat. Funkcija proteinov. Globularni proteini. Hemoglobin, mioglobin. Alosterične spremembe, kooperativnost. Fibrilarni proteini. Keratin, fibroin.

4. SINTEZA PROTEINOV

Ribosomi. Ribosomalni proteini, ribosomalna RNA. tRNA in aktivacija aminokislin. Genetski kod. Translacija. Iniciacija, translokacija, terminacija. Inhibicija proteinske sinteze. Post-translacijske modifikacije. Signalni peptid. Razgranja proteinov.

5. FOTOSINTEZA

Reakcije v fotosintezi. Svetlobna faza: biomolekule in svetloba, fotosintetski pigmenti, fotosistema I in II, Z-shema fotosinteze, fotofosforilacija in ciklična fotofosforilacija. Razlike med sintezo ATP v mitohondrijih in kloroplastih. Temotna faza: biosinteza ogljikovih hidratov v Calvin-Bensonovem ciklusu. Fotorespiracija. Hatch-Slackova pot za fiksiranje CO2.

6. BIOSINTEZA OGLJIKOVIH HIDRATOV

Glukoneogeneza (reakcije, energija, kontrola). Biosinteza oligosaharidov in polisaharidov. Hormonalno uravnavanje koncentracije glukoze.

7. BIOSINTEZA LIPIDOV

Sinteza maščobnih kislin. Uravnavanje metabolizma maščobnih kislin. Sinteza glicerolipidov, sfingolipidov in eikozanoidov. Biosinteza holesterola. Prenos lipidov po krvi. Holesterol kot prekurzor biološko pomembnih molekul.

8. BIOSINTEZA AMINOKISLIN

Vgrajevanje dušika v organske molekule. Vloga aminokislin. Anabolne poti aminokislin. Aminokisline kot izhodne spojine drugih molekul.

9. METABOLIZEM NUKLEINSKIH KISLIN

"De novo" biosinteza purinskih in pirimidinskih nukleotidov. Reciklažna pot biosinteze nukleotidov. Nastanek deoksiribonukleotidov.